Тежките санкции от Дисциплинарната комисия на УЕФА за Лебски в последните години не са рядкост. Наред с другото, клубът бива наказван и заради расистки прояви на част от феновете си.
През 2012 година клубът отнесе глоба от 30 хиляди евро и предупреждение за мач на празни трибуни. Това се случи заради плакат, който ултраси опънаха в сектор Б по време на домакинството на Сараево (1:0). Той гласеше „Ратко Младич и Аркан ви е**а, а сега наред сме ние!“.
През сезон 2016/17 Левски отнесе санкции и за двата мача с Марибор, като и в двете части от мотивите бе расистко поведение. За мача в Словения знаме донесе парична глоба и мач пред затворен сектор Б, в който да бъде поставено знаме „Кажи не на расизма“. Тази санкция бе изтърпяна през сезон 2017/18 в срещата със Сутиеска.
На реванша с Марибор обаче отново имаше изцепки и УЕФА бе безкомпромисна – 57 хиляди евро и мач при закрити врата. Така двубоят срещу Хайдук (1:2) бе без публика.
През 2006-а пък част от сините фенове извадиха фланелки със свастика по време на двубоя от груповата фаза на Шампионската лига с Барселона на „Васил Левски“.
